A Grand Theft Auto: San Andreas Xbox 360-as megjelenése után a PC-s változat is kapott a napokban egy új frissítést, amely automatikusan települt a Steamen keresztül. Sajnos az első beszámolók szerint ez több kárt okozott, mint hasznot. A játékosok visszajelzései alapján gondok támadtak a korábbi mentések betöltésével, valamint néhány támogatott felbontás is eltűnt. Mint később kiderült, ezek oka az lehet, hogy a fejlesztők a játék egy régi változata alapján készítették a frissítést, ezért merültek fel a problémák. Csakhogy emellett 16 dal is eltűnt a repertoárból (ugyanaz a 16, ami az Xbox 360-as változatból eleve kimaradt), ez vélhetően jogi okokra vezethető vissza. A következő dalok nem szólnak többet a játékban:
- Critical Beatdown
- Don't Let It Go To Your Head
- Express Yourself
- Grunt
- Hellraiser
- I Don't Give A f*ck
- Killing in the Name of
- Ring My Bell
- Rock Creek Park
- Running Away
- Running Down A Dream
- Soul Power '74
- The Payback
- Woman To Woman
- You Dropped A Bomb On Me
- Yum Yum
A mentés és felbontás hibáját egyébként egy rajongói frissítés már megoldotta.